1934年Andrew Moldavan試圖用光電探測器分析流過一根毛細管的單個細胞，提出被廣泛認為是流式細胞儀最早原型的設(shè)計觀念，此后流式細胞術(shù)經(jīng)過早期演變，在20世紀60年代后期和70年代快速發(fā)展。

1975年，George Kohler和Cesar Milstein提出了單克隆抗體技術(shù)。在此基礎(chǔ)上，生物學研究人員開始制造針對白細胞的單克隆抗體，獲得了一系列能產(chǎn)生靶向白細胞表面分化抗原的單克隆抗體的克隆，并用熒光染料標記抗體，為流式細胞研究中大量特異性的免疫試劑的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。

早期單克隆抗體的出現(xiàn)促進了流式在免疫學中的應(yīng)用，而近年來，流式又被越來越多地應(yīng)用于單克隆抗體的研發(fā)和生產(chǎn)中。

流式具有快速、高通量的特點，能在短時間分析出同一樣品中的多個靶點表達情況，結(jié)合細胞表型標記物可以對特定的細胞群和亞群進行分析。