統(tǒng)計發(fā)現(xiàn)，間充質(zhì)干細胞的臨床試驗涉及上百種疾病。神經(jīng)系統(tǒng)、心血管和骨科疾病是三類主要的研究領域，占比都在15%以上，總和超過一半。另外，糖尿病、GVHD的比例都在5%左右，是間充質(zhì)干細胞臨床應用的重要研究方向。

具體而言，脊髓損傷、多發(fā)性硬化、中風、肌萎縮側索硬化癥、老年癡呆癥、骨關節(jié)炎、股骨頭壞死、椎間盤退化、心肌梗死、肝硬化、克羅恩病、間質(zhì)性肺病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、勃起功能障礙以及卵巢早衰是研究得較為多的疾病。未來這些患者有望更早地受益于間充質(zhì)干細胞治療。